Naše kurzy

Nabízíme vysoce specializované kurzy se zaměřením na technologie DNA sekvenování a Real-Time PCR.

Kurzy lze pořádat i přímo na vašem pracovišti a lze je upravit tak, aby odpovídaly vašim potřebám.

Next-Generation Sekvenování

Úvod do Next-Generation sekvenování

Cílem kurzu je pomoci Vám získat základní orientaci v technologiích, principech, pojmech a možnostech využití Next-Generation sekvenování (NGS). Důraz je kladen na osvojení si schopnosti samostatného efektivního plánování NGS experimentů a základního zhodnocení výsledků. Probereme celou tematiku komplexně od A do Z v souvislostech

23. - 24.11.2020 09:00 - 17:00 ON LINE, Česká republika Volná místa: 14
17. - 18.5.2021 09:00 - 17:00 Warsaw, Polsko Volná místa: 25

Analýza výsledků Next-Generation sekvenování – Workshop pro začátečníky

Seznámíte se s různými formáty NGS dat, dozvíte se o konkrétních výhodách a nevýhodách používaných sekvenačních technologií a jak s nimi nakládat a pochopíte pozadí jednotlivých procesů používaných k úpravě NGS dat. Po tomto třídenním workshopu se nestanete bioinformatikem, ale budete na dobré cestě stát se…

19. - 21.5.2021 09:00 - 17:00 Warsaw, Polsko Volná místa: 12

Detekce a identifikace variant – Bioinformatický workshop

Detekce a identifikace – tzv. volání variant (variant calling) v sekvenčních datech je v principu jednoduchá záležitost, která však v praxi zdaleka jednoduchou není a rozlišení skutečné varianty (mutace) a experimentální chyby vyžaduje sofistikované výpočetní a / nebo heuristické techniky. V našem workshopu se přesně tyto postupy naučíte.

Assembly transkriptomu – Bioinformatický workshop

Sestavení (assembly) transkriptomu na základě dat z RNAseq je výkonným nástrojem pro detekci změn v genové expresi. Schopnost přesně provádět takové analýzy je však zásadně závislá na kvalitě assembly. Náš workshop je zaměřen na bioinformatické zpracování RNA-Seq dat a sestavení transkriptomu. Provedeme vás kontrolou kvality dat, filtrováním,…

RNASeq – Bioinformatický workshop

Pokud provádíte RNA-Seq experiment, je důležité, abyste porozuměli tomu, jak přistupovat k vašemu datovému souboru, jak zohlednit jeho specifika a jak vysledovat jeho slabiny, které mohou omezovat schopnost vyvodit správné závěry. Cílem našeho workshopu je, abyste si sami osvojili bioinformatické postupy zpracování RNA-Seq dat.  

Analýza metagenomu – Bioinformatický workshop

Metagenomika je studium genetického materiálu získaného přímo ze vzorků životního prostředí. To je užitečné, když se pokoušíte pochopit, jaké mikroby jsou ve vzorku přítomny a co dělají v konkrétním prostředí. V našem workshopu se naučíte zpracovávat metagenomická data počínaje kontrolou jejich kvality, filtrováním, assembly / klastrov…

De novo assembly – Bioinformatický workshop

Tento workshop se zaměřuje na vědce, kteří se chtějí dozvědět více o práci s daty získanými pomocí Oxford Nanopore se zvláštním zaměřením na de novo assembly. V rámci workshopu budete samostatně provádět vlastní de novo assembly za použití poskytnutých datových souborů.

Detekce virů metodou de-novo assembly – Bioinformatický workshop

V poslední době se pro potřeby detekce virů začaly intenzivně využívat technologie Next-Generation sekvenování. Jsou zcela zásadní pro zemědělskou produkci a lidské zdraví. Pravděpodobně nejpokročilejší způsob této detekce je založen na použití shotgunového sekvenování, následného assembly a identifikace virů. Na tento analytický postup je zaměřen náš…

Real-Time PCR

Praktický rychlokurz Real-Time PCR

Kurz Real-Time PCR, v kterém získáte sebejistotu v používání Vašeho přístroje, schopnost kriticky posoudit své výsledky a jistotu o správných pracovních postupech. Pro jakýkoliv Real-Time PCR přístroj - Applied Biosystems, Bio-Rad, Corbett Research, Roche, Stratagene/Agilent, Eppendorf, Illumina, Qiagen atd. Rozsah: 1-2 dny nebo podle potřebyV češtině nebo angličtině,…

Servis přístrojů

Kurz obsluhy sekvenátoru Applied Biosystems

Školení pro uživatele stávajících i nových sekvenátorů, ve Vaší laboratoři, za použití Vašeho přístroje a Vašich verzí softwaru. Dostanete přesně ty informace, které potřebujete.  Sekvenátory Applied Biosystems 310, 3100, 3130/xl, 3500/xl, 3730/xl. V češtině nebo angličtině, 1-3 dny nebo podle potřeby. Jednorázová i pravideln…

© SEQme s.r.o., 2012 - 2020. Všechna práva vyhrazena. Právní upozornění.
webdesign Beneš & Michl