Práce s daty a jejich vizualizace v R - Letní workshop

Úvod

R je výkonný statistický výpočetní jazyk, velmi efektivní a všestranný, umožňující rychlé výpočty a zobrazení přesných a elegantních grafů a tabulek. Obrovská komunita jeho uživatelů se navzájem podporuje a téměř každá otázka, kterou můžete mít, je již zodpovězena. R se používá všude tam, kde jsou data, včetně všech vědeckých disciplín a dalších odvětví, na která si vzpomenete. A to samozřejmě zahrnuje genomiku, transkriptomiku a všechny ty -omiky, které využívají NGS data. Uživatelé R uvádějí, že přínosy z učení R daleko převažují nad časem a úsilím věnovaným jeho učení.

Představujeme vám náš workshop zaměřený na vizualizaci NGS dat pomocí R. Důvodem výběru jazyka R není pouze jeho výpočetní výkon, ale také to, že je ideální pro vykreslování různých vědeckých dat, nejen NGS. Naučíte se základy R, práci s daty a principy analýzy dat. To vše vám umožní naučit se používat R pro vizualizaci dat, včetně vytváření všech nejběžnějších grafů používaných v publikacích NGS a podobně.

I když je tento workshop zaměřen na NGS data, nástroje a prvky zde vyučované lze využít i v jiných vědních oborech, jak již bylo zmíněno.

V průběhu workshopu…

• Probíhají přednášky kombinované s praktickými cvičeními, aby si účastníci mohli získané znalosti ihned vyzkoušet v praxi.
• Účastníci workshopu budou provádět všechny úkoly analýzy dat sami! Jeden počítač pro každého umožní plné zapojení jednoho každého účastníka do workshopu.
• Účastníkům bude poskytnuta výkonná počítačová infrastruktura, nejsou vyžadovány/povoleny žádné osobní notebooky.

Komu je workshop určen?

• Akce je určena pro začátečníky i mírně pokročilé uživatele R, kteří si chtějí prohloubit své znalosti v oblasti vizualizace dat.
• Máte-li pochyby, zda je workshop pro vás vhodný, kontaktujte nás.

Co se naučíte?

• Naučíte se základy R, jako je přiřazování proměnných, základní typy dat, používání R jako kalkulačky a podobně.
• Naučíte se importovat data a kombinovat různé zdroje dat.
• Naučíte se základní statistiku s vašimi daty.
• Naučíte se různé druhy grafů pro NGS data, včetně jednorozměrných až vícerozměrných grafů.
• Budete mít možnost komunikovat se zkušeným týmem přednášejících a dalšími účastníky.

A co dostanete?

• Poslední den workshopu dostanete bootovatelný USB disk, na němž budou uloženy všechny použité nástroje a všechna Vámi analyzovaná data
• Odnesete si svou čtyřdenní práci s sebou a můžete na ni kdykoliv navázat po návratu do své laboratoře či kanceláře!

Organizační informace

Jazyk: Angličtina

Registrační poplatek zahrnuje: Materiály k workshopu, obědy a občerstvení během přednášek. Cestovní výdaje si účastníci hradí sami.

Program workshopu

Přednášející

Tým přednášejících je složen z bioinformatiků firmy SEQme, kteří se zaměřují na analýzu dat a související úkony a jsou tudíž schopni poskytnout komplexní vhled do celé problematiky v souvislostech.

Zdroje

Základní znalost BASH, terminálu a R není požadovaná, ale je výhodou. Doporučujeme projít některý z volně dostupných návodů, např. na tomto nebo tomto odkazu.

Speciální nabídka:

Všechny naše kurzy a workshopy lze uspořádat rovněž na vašem pracovišti, pro vaši pracovní skupinu. Tedy jako akci na míru. Některé z našich akcí dokonce takto – na požadavek klienta – vznikly. Výhodou tohoto formátu je samozřejmě možnost připravit akci na klíč pro váš tým, reflektovat vaše specifické požadavky a potřeby, včetně možnosti pracovat s vašimi daty. V případě zájmu nás neváhejte kontaktovat.