Praktický rychlokurz Real-Time PCR

Metoda Real-Time PCR se využívá od počátku 90. let minulého století a je rutinním standardem nejen pro řadu diagnostických aplikací. Díky tomu je často pokládána za všeobecně známou a snadno zvládnutelnou a málo pozornosti je někdy věnováno správnému zaškolení osob, které ji mají využívat v praxi, ať již pro měření genové exprese metodami relativní kvantifikace nebo např. pro kvantifikaci na bázi standardní křivky v diagnostice či pro forenzní účely.

V našem kurzu získáte sebejistotu v používání vašeho Real-Time PCR přístroje, schopnost kriticky posoudit své výsledky a jistotu o správných pracovních postupech. Je jedno, jaký přístroj máte k dispozici či pro jaké účely hodláte Real-Time PCR využívat nebo již využíváte, program tohoto kurzu, který probíhá na vašem pracovišti, je vždy přizpůsoben aktuální situaci a vašim potřebám. Cílem kurzu je poskytnout přehled technologie, principů, pojmů a možností využití Real-Time PCR. Důraz je typicky kladen především na plánování (design) experimentů a správné zhodnocení výsledků, což jsou dvě oblasti, kde dochází k nejčastějším chybám.

 


 

Komu je kurz určen?

Kurz je vhodný pro všechny, kdo teprve plánují používání technologie Real-Time PCR, i pro ty, kteří si chtějí prohloubit své znalosti. Předchozí znalost technologie Real-Time PCR není nutná.


Co se naučíte?

  • Jak navrhnout a provést experiment na bázi Real-Time PCR
  • Jak provádět vyhodnocení výsledků pomocí různých metod (relativní kvantifikace, kvantifikace pomocí standardní křivky, alelická diskriminace, high-resolution melting, atd.) včetně praktických ukázek za použití vhodných datových souborů
  • Jak identifikovat problém v konkrétním experimentu na základě interpretace amplifikačních grafů a jak jej eliminovat
  • Jaké zvolit kontroly včetně endogenních
  • Získáte informace o organizaci laboratoře a správných pracovních postupech
  • Budete mít možnost komunikovat se zkušeným přednášejícím a diskutovat s ním své aktuální dotazy v úzkém kolektivu svých spolupracovníků
  • A mnohé další

 


 

Program kurzu:

Projdeme s vámi vaše výsledky a provedeme analýzu konkrétních problémů. Rozebereme možnosti vašich přístrojů pro Real-Time PCR s ohledem na vaše cíle a aplikace. Program kurzu upravíme na míru vašemu přístroji, pracovišti a potřebám. Sami si řeknete, na co se chcete zaměřit.


Orientační nástin programu (k diskuzi):

  • Princip a použití technologie Real-Time PCR
  • Základy analýzy dat
    • amplifikační grafy, metody odečtu Cq hodnot
    • analýza křivek tání
  • Návrh a validace esejí – design in silico
    • sondy a nespecifická barviva
    • repetitivní motivy, SNP, sekundární struktury
    • specificita
  • Optimalizace
    • standardní křivka a křivka tání
    • účinnost amplifikace a metody stanovení
    • specificita, citlivost
  • Kvantifikace pomocí standardní křivky
    • plánování, provedení a vyhodnocování
  • Relativní kvantifikace nejen genové exprese
    • kvantifikační modely
    • korekce amplifikační účinnosti
    • volba a použití referenčních genů
    • alternativní normalizační strategie
    • distribuce dat a volba vhodného statistického testu
    • interpretace výsledků na základě p‑value
  • Praktická doporučení
    • organizace laboratoře
    • přístrojové a softwarové vybavení
    • zbytné a nezbytné kontroly

 


 

Organizace kurzu

  • Jazyk: Čeština nebo angličtina
  • Místo konání: Vaše laboratoř či pracoviště
  • Termín konání: Dohodou
  • Počet účastníků: Dohodou, vždy pouze členové vašeho týmu
  • Časový rozsah kurz: Dohodou, typicky 1-2 dny
  • Cena: Vyžádejte si cenovou nabídku
  • Upozorňujeme, že v rámci kurzu mohou být po dohodě i prováděny laboratorní experimenty.

Žádné termíny pro tento kurz nejsou vypsány.


Fotografie z našich kurzů...


© SEQme s.r.o., 2012 - 2020. Všechna práva vyhrazena. Právní upozornění.
webdesign Beneš & Michl