NGS Services à la carte

Náš cíl - Špičkové služby v Next-Generation sekvenování

Jsme hrdí na to, že poskytujeme komplexní řešení v oblasti Next-Generation sekvenování. Vy víte, co chcete, my víme, jak toho dosáhnout.

Nabízíme:

  • Jednotlivé dílčí kroky nutné pro úspěch vašeho NGS projektu, počínaje poradenstvím při jeho designu, přes přípravu DNA/RNA sekvenačních knihoven a vlastní sekvenování až po standardní nebo specifickou analýzu dat
  • Špičkové NGS systémy všech klíčových hráčů na trhu (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore)
  • Různé optimalizované služby NGS, jako je rychlé sekvenování exomů, cílené sekvenování předem vybraných genů nebo analýza metagenomu
  • Řešení pro malé projekty NGS - ShareSeq
  • Odbornost v oblasti bioinformatických analýz
  • Přísnou kontrolu kvality na úrovni vzorku, knihoven a dat
  • On-line systém objednávání, sledování výsledků a doručování dat - vše k dispozici 24/7
  • Kurzy nebo workshopy, také přizpůsobené potřebám vašeho týmu

 

Náš tým pro vás provádí:

  • Návrh a efektivní plánování NGS experimentu na základě vámi definovaných cílů
  • Zpracování vzorků
  • Vývoj a aplikaci bioinformatických postupů
  • Odborné poradenství ke všem krokům pracovního postupu, pro optimalizaci experimentu nebo řešení problémů

 


 

Přehled služeb:

 

Stáhněte si informativní leták k nabídce našich NGS služeb.

 


 

Bioinformatické služby - Vyvíjíme řešení na míru vašim potřebám

Analýza dat tvoří nedílnou součást našich služeb na poli Next-Gen sekvenování. Naši bioinformatici s vámi prodiskutují vaše cíle a následně analyzují data, a to i v případě, že jste je získali sekvenováním v nějaké jiné laboratoři. Standardní postupy analýzy dat lze rovněž upravit podle vašich specifických potřeb, případně na základě provedené pilotní analýzy.

 

Váš cíl

Standardní analýza

Specifická analýza

De novo Sequencing
De novo assembly
Reference-based genome assembly
Gene/ORF prediction
Gene annotation and classification
Variant calling (SNP, INDELs)
Whole Genome Resequencing
Alignment and summary
Variant calling (SNP, INDELs) and annotation
Comparative analysis
Structural variation (CNV) and annotation
Exome /Target Sequencing
Alignment and summary
Variant calling (SNP, INDELs) 
Variant annotation
Comparative Analysis
Transcriptome Resequencing
Transcript mapping
Expression profiles
Differentially expressed genes (DE)
Fusion gene analysis
Gene set analysis
Variant calling and annotation
Comparative analysis
Transcriptome De Novo Sequencing
Sequencing data correction
Transcriptome de novo assembly
Annotation (GO)
Differentially expressed genes
Annotation (GO), visualization
Variant calling and annotation
smRNA Sequencing
Expression profiles
Prediction of known and novel smRNA / miRNA
Differentially expressed miRNA
Gene set analysis
Comparative analysis
Metagenome Sequencing
Contig assembly
OTU clustering and classification
Alignment and summary
Gene prediction
Prediction of functionality of each gene candidate
Statistical analysis
Epigenome Sequencing
Global methylation profiles
Specific methylation profiles
Differentially methylated regions (DMR)
DMR-associated genes
Gene set analysis
Comparative analysis

 

Navštivte naše Bioinformatické workshopy.

 


 

Poplatky za naše bioinformatické služby jsou účtovány na základě sazeb odvozených od doby trvání spolupráce - od poplatků za krátkodobé či jednorázové bioinformatické úkony až po poplatky účtované při dlouhodobé spolupráci na projektech velkého rozsahu. Jsou založeny na době potřebné pro provedení sjednaných bioinformatických úkonů (sazba na hodinu, den, týden, měsíc) a zahrnují i potřebnou výpočetní kapacitu. V případě zájmu nás kontaktujte, dle rozsahu vašeho projektu jsme schopni poměrně přesně dopředu odhadnout potřebnou dobu realizace / náklady na analýzu.

Vy víte, co hledáte. My to umíme najít.

Zaslat dotaz - poptávku můžete zde.

 

 

© SEQme s.r.o., 2012 - 2020. Všechna práva vyhrazena. Právní upozornění.
webdesign Beneš & Michl