NGS Services à la carte

Nabízíme:

Jednotlivé dílčí kroky nutné pro úspěch vašeho NGS projektu, počínaje poradenstvím při jeho designu, přes přípravu DNA/RNA sekvenačních knihoven a vlastní sekvenování až po standardní nebo specifickou analýzu dat
Špičkové NGS systémy všech klíčových hráčů na trhu (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore)
Různé optimalizované služby NGS, jako je rychlé sekvenování exomů, cílené sekvenování předem vybraných genů nebo analýza metagenomu
Řešení pro malé projekty NGS - ShareSeq
Odbornost v oblasti bioinformatických analýz
Přísnou kontrolu kvality na úrovni vzorku, knihoven a dat
On-line systém objednávání, sledování výsledků a doručování dat - vše k dispozici 24/7
Kurzy nebo workshopy, také přizpůsobené potřebám vašeho týmu

Náš tým pro vás provádí:

Návrh a efektivní plánování NGS experimentu na základě vámi definovaných cílů
Zpracování vzorků
Analýza dat a vývoj bioinformatických postupů na zakázku
Odborné poradenství ke všem krokům pracovního postupu, pro optimalizaci experimentu nebo řešení problémů

Přehled služeb:

Bioinformatické služby - Vyvíjíme řešení na míru vašim potřebám

Analýza dat tvoří nedílnou součást našich služeb na poli Next-Gen sekvenování. Naši bioinformatici s vámi prodiskutují vaše cíle a následně analyzují data, a to i v případě, že jste je získali sekvenováním v nějaké jiné laboratoři. Standardní postupy analýzy dat lze rovněž upravit podle vašich specifických potřeb, případně na základě provedené pilotní analýzy.

Váš cíl	Standardní analýza	Specifická analýza
De novo Sequencing	De novo assembly Reference-based genome assembly	Gene/ORF prediction Gene annotation and classification Variant calling (SNP, INDELs)
Whole Genome Resequencing	Alignment and summary Variant calling (SNP, INDELs) and annotation	Comparative analysis Structural variation (CNV) and annotation
Exome /Target Sequencing	Alignment and summary Variant calling (SNP, INDELs) Variant annotation	Comparative Analysis
Transcriptome Resequencing	Transcript mapping Expression profiles Differentially expressed genes (DE)	Fusion gene analysis Gene set analysis Variant calling and annotation Comparative analysis
Transcriptome De Novo Sequencing	Sequencing data correction Transcriptome de novo assembly Annotation (GO)	Differentially expressed genes Annotation (GO), visualization Variant calling and annotation
smRNA Sequencing	Expression profiles Prediction of known and novel smRNA / miRNA	Differentially expressed miRNA Gene set analysis Comparative analysis
Metagenome Sequencing	Contig assembly OTU clustering and classification Alignment and summary	Gene prediction Prediction of functionality of each gene candidate Statistical analysis
Epigenome Sequencing Global methylation profiles	Specific methylation profiles Differentially methylated regions (DMR)	DMR-associated genes Gene set analysis Comparative analysis

Navštivte naše Bioinformatické workshopy.

Poplatky za naše bioinformatické služby jsou účtovány na základě sazeb odvozených od doby trvání spolupráce - od poplatků za krátkodobé či jednorázové bioinformatické úkony až po poplatky účtované při dlouhodobé spolupráci na projektech velkého rozsahu. Jsou založeny na době potřebné pro provedení sjednaných bioinformatických úkonů (sazba na hodinu, den, týden, měsíc) a zahrnují i potřebnou výpočetní kapacitu. V případě zájmu nás kontaktujte, dle rozsahu vašeho projektu jsme schopni poměrně přesně dopředu odhadnout potřebnou dobu realizace / náklady na analýzu.

Vy víte, co hledáte. My to umíme najít.

Zaslat dotaz - poptávku můžete zde.

NGS Services à la carte

Náš cíl - Špičkové služby v Next-Generation sekvenování

Nabízíme:

Náš tým pro vás provádí:

Přehled služeb:

Bioinformatické služby - Vyvíjíme řešení na míru vašim potřebám

Váš cíl

Standardní analýza

Specifická analýza

Sekvenování genomů kvasinek

Rychlé odkazy

Kontaktujte nás