Kurz Základy Next-Generation sekvenování

20. - 21.5.2019 08:30 - 17:00 Brno, Česká republika 350 € bez DPH Angličtina Volná místa: 2

Zorientujte se v možnostech masivně paralelního sekvenování a naučte se efektivně plánovat a provádět vlastní experimenty!
Kurz je určen pro molekulární biology se zájmem o technologii Next-Generation sekvenování (NGS). Předpokladem je počítačová gramotnost a základní znalosti molekulární biologie (DNA, RNA, genová exprese, PCR).

Cílem kurzu je pomoci Vám získat základní orientaci v technologiích, principech, pojmech a možnostech využití NGS. Důraz je kladen na osvojení si schopnosti samostatného EFEKTIVNÍHO plánování NGS experimentů a základního zhodnocení výsledků.

Poznámka: Pokud se chcete naučit provádět základy analýzy NGS dat, doporučujeme vaší pozornosti naši další akci - Bioinformatické zpracování NGS dat - Workshop pro začátečníky!, která termínově navazuje na tento dvoudenní kurz.

 

Komu je kurz určen?

Kurz je vhodný pro všechny, kdo teprve plánují používání technologií masivně paralelního (tzv. next-generation) sekvenování, i pro ty, kteří si chtějí prohloubit své znalosti principů těchto metod a jejich využití. Předchozí znalost sekvenačních technologií není nutná. 


Co se naučíte?

  • Jak navrhnout experiment na bázi NGS včetně efektivního plánování rozpočtu
  • Jak provádět základní operace s daty včetně informací o potřebné počítačové infrastruktuře
  • Získáte přehled rozmanitých NGS aplikací
  • Budete mít možnost komunikovat se zkušenými přednášejícími a ostatními účastníky

 


 

Program kurzu:

  • Úvod do problematiky
    • Historické souvislosti a přehled současných technologií
    • Základní principy a pojmy
    • Typické aplikace a standardní workflow 
  • Sekvenační technologie
    • Princip sekvenace technologiemi NGS
    • Specifikace technologií a přístrojů Illumina, Thermo Fisher (IonTorrent) a Pacific Biosciences
    • Technologické novinky 
  • Základní aplikace a metody
    • Přehled aplikací NGS
    • Příprava sekvenačních knihoven
    • Nabohacovací techniky (Target enrichment) 
    •  
  • Plánování sekvenace
    • Volba aplikace ve vztahu k cílům experimentu
    • Specifické požadavky ve vztahu k aplikaci
    • Design technického řešení 
  • Vyhodnocení výsledků, analýza dat
    • Obecný úvod do analýzy dat
    • Přehled běžných datových formátů
    • Kvalitativní zhodnocení výsledků
    • Zvýšení kvality datasetu
    • Přehled používaného software
    • Základní metody sekundární analýzy dat (de-novo assembly, mapování na referenci, identifikace variant, …)
    • Evaluace výsledků sekundární analýzy (statistika)
    • Zobrazení výsledků sekundární analýzy

 

 


 

Organizace kurzu

  • Jazyk: Angličtina
  • Registrační poplatek zahrnuje: Materiály ke kurzu, obědy/občerstvení
  • Jak se dostat na místo konání?
  • Ubytování a cestovní výdaje si účastníci zajišťují a hradí sami. Upozorňujeme, že v rámci kurzu nejsou prováděny žádné laboratorní experimenty.

 

Ke stažení


Kurz Základy Next-Generation sekvenování

Datum: 20. - 21.5.2019
Čas: 08:30 - 17:00
Místo: Brno, Česká republika
Adresa: JIC INBIT, Kamenice 34, Brno
Cena: 350 € bez DPH
Jazyk: Angličtina
Volná místa: 2
Chci se přihlásit

Fotografie z našich kurzů...




© SEQme s.r.o., 2012 - 2019. Všechna práva vyhrazena. Právní upozornění.
webdesign Beneš & Michl