Návody a dotazy

V objednávkovém formuláři pro Sangerovo sekvenování je nastaven limit pro velikost templátu. Proč?

Ano, to je pravda, templát musí být v rozsahu 100 bp až 20.000 bp.

Sekvenovat templáty kratší než 100 bp je poměrně neobvyklé. Uvažujeme-li primer o délce 20 bází a začátek dobré sekvence asi 20 bází za primerem, znamená to, že z takového templátu nezískáte víc než 60 bází s vysokou kvalitou.Rozhodli jsme se proto nastavit tento limit, hlavně proto, abychom na tento problém upozornili a možná vás donutili k tomu se nad tím ještě jednou zamyslet. Na druhou stranu jsme si samozřejmě vědomi, že můžete mít velmi dobré důvody sekvenovat templáty kratší než 100 bp. V takovém případě prosím uveďte jejich délku jako 100 bp, i když jsou kratší. Na způsob jejich sekvenování to nemá vliv. Doporučujeme vaší pozornosti i tento návod na sekvenování krátkých templátů.

Trochu jiná je situace v případě templátů delších než 20.000 bp.Takové templáty musí být sekvenovány pomocí speciálních protokolů a proto je nemůžeme přijmout pro standardní zpracování. Máte-li takové templáty nebo i delší (např. BAC) a chcete využít Sangerovo sekvenování, prosím kontaktujte nás. Doporučujeme vaší pozornosti i protokol PlasmidSeq.

Zpět na seznam
© SEQme s.r.o., 2012 - 2024. Všechna práva vyhrazena. Právní upozornění.
webdesign Beneš & Michl